SimMechanics 2nd Generationで同様の現象を確認しました。
さだかではありませんが、特異点という言葉からジンバルロックが発生した可能性もあります。
ジンバルロックの詳細は、ネット等でお調べください。
そこで、簡易な対策としてはGimbal Jontを同様の機能を持つSpherical Jointに変えるという手があります。
その案でうまくいくことを確認しました。(添付参照)
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