動画解析での物体の追跡・カウントを行う際の計上対象の選別方法

Question

Noruji Muto 2021-12-11

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https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/1608885-

评论： Noruji Muto 2021-12-12

在 MATLAB Online 中打开

お世話になります。

とある微粒子が浮上する現象に関する研究しています。

微粒子が浮上する所を動画撮影し、浮上した粒子の個数を動画解析にて取得したいのですが、

数えたくないものまで数えてしまっているようです。↓

浮上した微粒子のみを追跡、カウントしたいのです。↓

尚、現在使用しているコードは以下の通りです。

「success_Trim3.mp4」はzipにてこの質問に添付してありますのでご参照下さい。

VideoSize = [432 528];
filename = 'success_Trim3.mp4';
hvfr = VideoReader(filename);
hblob = vision.BlobAnalysis( ...
                'AreaOutputPort', false, ...
                'BoundingBoxOutputPort', false, ...
                'OutputDataType', 'single', ...
                'MinimumBlobArea', 7, ...
                'MaximumBlobArea', 300, ...
                'MaximumCount', 1500);
% Acknowledgement
%ackText = ['Data set courtesy of Jonathan Young and Michael Elowitz, ' ...
%             'California Institute of Technology'];
         
         hVideo = vision.VideoPlayer;
hVideo.Name  = 'Results';
hVideo.Position(1) = round(hVideo.Position(1));
hVideo.Position(2) = round(hVideo.Position(2));
hVideo.Position([4 3]) = 30+VideoSize;
frameCount = int16(1);
while hasFrame(hvfr)
    % Read input video frame
    image = rgb2gray(im2single(readFrame(hvfr)));%ここでエラーが発生
    % Apply a combination of morphological dilation and image arithmetic
    % operations to remove uneven illumination and to emphasize the
    % boundaries between the cells.
    y1 = 2*image - imdilate(image, strel('square',7));
    y1(y1<0) = 0;
    y1(y1>1) = 1;
    y2 = imdilate(y1, strel('square',7)) - y1;
    th = multithresh(y2);      % Determine threshold using Otsu's method    
    y3 = (y2 <= th*0.7);       % Binarize the image.
    
    Centroid = step(hblob, y3);   % Calculate the centroid
    numBlobs = size(Centroid,1);  % and number of cells.
    % Display the number of frames and cells.
    frameBlobTxt = sprintf('Frame %d, Count %d', frameCount, numBlobs);
    image = insertText(image, [1 1], frameBlobTxt, ...
            'FontSize', 16, 'BoxOpacity', 0, 'TextColor', 'white');
    image = insertText(image, [1 size(image,1)], ackText, ...
            'FontSize', 10, 'AnchorPoint', 'LeftBottom', ...
            'BoxOpacity', 0, 'TextColor', 'white');
    % Display video
    image_out = insertMarker(image, Centroid, '*', 'Color', 'green');   
    step(hVideo, image_out);
    frameCount = frameCount + 1;
end

数えたいものを設定し、数えたくないものを計上対象から除外する方法をご存知の方、

是非ご教示いただけないでしょうか？

よろしくお願いいたします。

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Atsushi Ueno 2021-12-12

対象の画素も少なく(小さく)、数えたくないものの特徴を選り分ける事が難しそうですね。

撮影条件を整えて、微粒子が浮上する範囲を特定出来るようにすれば良いのではないでしょうか？

Noruji Muto 2021-12-12

アドバイスありがとうございます。

欲を言えば、ハイスピードカメラや遠距離顕微鏡レンズを使用したいのですが、なかなか難しい所です。

ちなみに粒子のサイズは直径として言うなら40~45μmで、この質問で挙げた動画自体、切り抜きや動画エリアを絞ったものです。

さらに範囲を絞ることは可能ですが、そのためには動画を部分的に塗りつぶすといった事が必要になります。

ただしその方法は不明で調査中です。

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