手前味噌ですが、自分の回答を参考にお答えします
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まずは画像を読み込みます
I = imread('test.png');
imshow(I)
次に抽出したい座標をとりましょう
% [xi,yi] = getpts
x = [48, 422, 39, 429]';
y = [160, 66, 246, 176]';
originalPoints = [x,y];
そして写像変換したい座標を決めます
いただいたリンクを参考にしました
ow = floor(norm(originalPoints(2,:) - originalPoints(1,:)));
oh = floor(norm(originalPoints(3,:) - originalPoints(1,:)));
fixedPoints = [0, 0; ow, 0; 0, oh; ow, oh];
tform = fitgeotrans(originalPoints, fixedPoints, 'projective');
RA = imref2d([size(I,1) size(I,2)], [1 ow], [1 oh]);
[out,r]= imwarp(I, tform,'OutputView', RA);
見てみましょう
imshow(out,r)
axis off