描画中の点を別途 plot 関数で描き、その点のオブジェクト hcurrent のデータ点の値を更新する形で実現できます。
figure
axis([-1.5,1.5,-1.5,1.5])
axis square
h = animatedline;
hold on
t = 0:0.1:4*pi;
x = cos(t);
y = sin(t);
hcurrent = plot(x(1),y(1),'o');
for k = 1:length(x)
hcurrent.XData = x(k);
hcurrent.YData = y(k);
addpoints(h,x(k),y(k));
drawnow
end
hold off
