Stateflow APIのfindメソッドで既存のStateflowオブジェクトを探せます。
% モデルのオブジェクトを取得
obj = get_param(bdroot, 'Object');
% モデル内からChartブロックを探す
objChart = obj.find('-isa', 'Stateflow.Chart')
% Chart内のDataオブジェクトを見つける
objData = objChart.find('-isa', 'Stateflow.Data')
%% もしくは
% もしDataの変数名が分かっているのであれば、変数名をオプションにしてモデルのルートから探すこともできます
objData = obj.find('-isa', 'Stateflow.Data', 'Name', 'u');
下記がご参考になると思います。
