とりあえず"文字化けせずにデータを読み込む"に焦点をあてます。
文字化けというのは文字コードが一致していないだけなので、きちんと指定して上げれば良いんですよね。ここではUTF-8にしてます。
ただ、単体のデータなら気象庁から手動で落とした方が早いかなと思います。
スクレイピングされるなら納得ですが、少し手ごわいかも知れません。
url = 'https://www.data.jma.go.jp/obd/stats/etrn/view/10min_s1.php?prec_no=44&block_no=47662&year=2021&month=1&day=1&view=';
options = weboptions('CharacterEncoding','UTF-8');
foo = webread(url,options);