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清除表中的杂乱数据和缺失数据

此示例说明如何清理和重新组织拥有杂乱和缺失数据值的表。首先,您可以使用导入工具或 summaryismissing 等函数来标识缺失数据。您可以使用 standardizeMissingfillmissingrmmissing 函数来标准化、填充或删除缺失值。然后,您可以通过重新整理表来进一步清洗它。您可以使用 sortrowsmovevars 函数来重新排列表的行和变量。

检查文件中的数据

使用“导入工具”检查示例逗号分隔值 (CSV) 文件 messy.csv 中的数据。该工具支持预览数据,并且可用于指定数据导入方式。要在“导入工具”中检查 messy.csv,请在 MATLAB® 中打开此示例后,转至主页选项卡,点击变量部分中的导入数据,并使用文件选择对话框打开 messy.csv

导入工具显示 messy.csv 具有五个包含文本和数值的列。

Import Tool, showing the five columns of text and numeric data in the messy.csv file

该文件包含许多不同的缺失数据指示符:

  • 空文本

  • 句点(.)

  • NA

  • NaN

  • -99

导入工具会自动识别(但不在外观上突出显示)一些缺失数据指示符,例如数值列中的 NaN 和文本列中的空文本。

该工具会突出显示其他指示符,如出现在列 B 中的空文本、句点和 NA。这些值不是标准的缺失值。但是,数值列中的非数值可能表示缺失值。在导入数据时,您可以指定这些值也应被视为缺失值。

当数值数据由正值组成时,如出现单个负值(如 -99),它可能是缺失数据的标志。如果像 -99 这样的数字表示表中的缺失数据,则您在清洗表时必须指定它是缺失值。

以表的形式导入数据

您可以通过导入工具将数据导入 MATLAB 工作区。但您也可以使用 readtable 函数从文件中读取数据,并以表的形式导入数据。

使用 readtable 函数导入 messy.csv 中的数据。要将文本数据读入字符串数组形式的表变量,请使用 TextType 名称-值参量。要将数值列中指定的非数值视为缺失值,请使用 TreatAsMissing 名称-值参量。对于包含文本数据的列 ACreadtable 将任何空文本作为缺失字符串导入,这些字符串显示为 <missing>。对于包含数值数据的列 BDE,当您使用 TreatAsMissing 指定它们时,readtable 会将空文本作为 NaN 值导入,还会将 .NA 作为 NaN 值导入。但值 -99 保持不变,因为它们是数值。

messyTable = readtable("messy.csv","TextType","string","TreatAsMissing",[".","NA"])
messyTable=21×5 table
      A        B          C         D       E  
    ______    ____    _________    ____    ____

    "afe1"     NaN    "yes"           3       3
    "egh3"     NaN    "no"            7       7
    "wth4"     -99    "yes"         -99     -99
    "atn2"    23.7    <missing>     NaN    23.7
    "arg1"     NaN    "yes"           5     NaN
    "jre3"    34.6    "yes"        34.6    34.6
    "wen9"     234    "yes"         234     234
    "ple2"       2    "no"            2       2
    "dbo8"       5    "no"            5       5
    "oii4"       5    "yes"           5       5
    "wnk3"     245    "yes"         245     245
    "abk6"     563    "no"          563     563
    "pnj5"     463    "no"          463     463
    "wnn3"       6    "no"            6       6
    "oks9"      23    "yes"          23      23
    "wba3"      14    "yes"          14      14
      ⋮

查看表的摘要

要查看表的摘要,请使用 summary 函数。对于每个表变量,摘要显示每个表变量的数据类型和其他描述性统计量。例如,summary 显示 messyTable 的每个数值变量中缺失值的数目。

summary(messyTable)
messyTable: 21x5 table

Variables:

    A: string
    B: double
    C: string
    D: double
    E: double

Statistics for applicable variables:

         NumMissing      Min        Median         Max         Mean            Std     

    A        0                                                                         
    B        3           -99        22.5000        563        90.1056        174.0532  
    C        1                                                                         
    D        2           -99             14        563        83.8000        171.0755  
    E        1           -99        21.5000        563        81.5950        166.7100  

查找具有缺失值的行

要查找 messyTable 中至少有一个缺失值的行,请使用 ismissing 函数。如果您的数据中有非标准缺失值,例如 -99,您可以将其与标准缺失值一起指定。

ismissing 的输出是逻辑数组,用于标识 messyTable 中具有缺失值的元素。

missingElements = ismissing(messyTable,{string(missing),NaN,-99})
missingElements = 21x5 logical array

   0   1   0   0   0
   0   1   0   0   0
   0   1   0   1   1
   0   0   1   1   0
   0   1   0   0   1
   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0
      ⋮

要创建标识有缺失值的行的逻辑向量,请使用 any 函数。

rowsWithMissingValues = any(missingElements,2)
rowsWithMissingValues = 21x1 logical array

   1
   1
   1
   1
   1
   0
   0
   0
   0
   0
      ⋮

要对表进行索引并只返回有缺失值的行,请使用逻辑向量 rowsWithMissingValues

missingValuesTable = messyTable(rowsWithMissingValues,:)
missingValuesTable=6×5 table
      A        B          C         D      E  
    ______    ____    _________    ___    ____

    "afe1"     NaN    "yes"          3       3
    "egh3"     NaN    "no"           7       7
    "wth4"     -99    "yes"        -99     -99
    "atn2"    23.7    <missing>    NaN    23.7
    "arg1"     NaN    "yes"          5     NaN
    "gry5"      21    "yes"        NaN      21

填充缺失值

清洗表中缺失值的一个策略是用更有意义的值替换它们。您可以通过插入标准缺失值来替换非标准缺失值。然后,您还可以用调整后的值来填充缺失值。例如,您可以用最近邻值或表变量的均值来填充缺失值。

在此示例中,-99 是非标准值,用于指示缺失值。要用标准缺失值替换 -99 的实例,请使用 standardizeMissing 函数。NaN 是单精度和双精度浮点数值数组的标准缺失值。

messyTable = standardizeMissing(messyTable,-99)
messyTable=21×5 table
      A        B          C         D       E  
    ______    ____    _________    ____    ____

    "afe1"     NaN    "yes"           3       3
    "egh3"     NaN    "no"            7       7
    "wth4"     NaN    "yes"         NaN     NaN
    "atn2"    23.7    <missing>     NaN    23.7
    "arg1"     NaN    "yes"           5     NaN
    "jre3"    34.6    "yes"        34.6    34.6
    "wen9"     234    "yes"         234     234
    "ple2"       2    "no"            2       2
    "dbo8"       5    "no"            5       5
    "oii4"       5    "yes"           5       5
    "wnk3"     245    "yes"         245     245
    "abk6"     563    "no"          563     563
    "pnj5"     463    "no"          463     463
    "wnn3"       6    "no"            6       6
    "oks9"      23    "yes"          23      23
    "wba3"      14    "yes"          14      14
      ⋮

要填充缺失值,请使用 fillmissing 函数。该函数提供多个填充缺失值的方法。例如,用最近邻的非缺失值来填充缺失值。

filledTable = fillmissing(messyTable,"nearest")
filledTable=21×5 table
      A        B        C       D       E  
    ______    ____    _____    ____    ____

    "afe1"    23.7    "yes"       3       3
    "egh3"    23.7    "no"        7       7
    "wth4"    23.7    "yes"       7    23.7
    "atn2"    23.7    "yes"       5    23.7
    "arg1"    34.6    "yes"       5    34.6
    "jre3"    34.6    "yes"    34.6    34.6
    "wen9"     234    "yes"     234     234
    "ple2"       2    "no"        2       2
    "dbo8"       5    "no"        5       5
    "oii4"       5    "yes"       5       5
    "wnk3"     245    "yes"     245     245
    "abk6"     563    "no"      563     563
    "pnj5"     463    "no"      463     463
    "wnn3"       6    "no"        6       6
    "oks9"      23    "yes"      23      23
    "wba3"      14    "yes"      14      14
      ⋮

删除具有缺失值的行

清洗表中缺失值的另一个策略是删除包含这些值的行。

要删除包含缺失值的行,请使用 rmmissing 函数。

remainingTable = rmmissing(messyTable)
remainingTable=15×5 table
      A        B        C       D       E  
    ______    ____    _____    ____    ____

    "jre3"    34.6    "yes"    34.6    34.6
    "wen9"     234    "yes"     234     234
    "ple2"       2    "no"        2       2
    "dbo8"       5    "no"        5       5
    "oii4"       5    "yes"       5       5
    "wnk3"     245    "yes"     245     245
    "abk6"     563    "no"      563     563
    "pnj5"     463    "no"      463     463
    "wnn3"       6    "no"        6       6
    "oks9"      23    "yes"      23      23
    "wba3"      14    "yes"      14      14
    "pkn4"       2    "no"        2       2
    "adw3"      22    "no"       22      22
    "poj2"    34.6    "yes"    34.6    34.6
    "bas8"      23    "no"       23      23

排序和重新排列表行和变量

一旦清除了表中的缺失值,就可以用其他方式组织它。例如,您可以按照一个或多个变量中的值对表行进行排序。

按照第一个变量 A 中的值对行进行排序。

sortedTable = sortrows(remainingTable)
sortedTable=15×5 table
      A        B        C       D       E  
    ______    ____    _____    ____    ____

    "abk6"     563    "no"      563     563
    "adw3"      22    "no"       22      22
    "bas8"      23    "no"       23      23
    "dbo8"       5    "no"        5       5
    "jre3"    34.6    "yes"    34.6    34.6
    "oii4"       5    "yes"       5       5
    "oks9"      23    "yes"      23      23
    "pkn4"       2    "no"        2       2
    "ple2"       2    "no"        2       2
    "pnj5"     463    "no"      463     463
    "poj2"    34.6    "yes"    34.6    34.6
    "wba3"      14    "yes"      14      14
    "wen9"     234    "yes"     234     234
    "wnk3"     245    "yes"     245     245
    "wnn3"       6    "no"        6       6

按照 C 以降序对行进行排序,然后按照 A 以升序排序。

sortedBy2Vars = sortrows(remainingTable,["C","A"],["descend","ascend"])
sortedBy2Vars=15×5 table
      A        B        C       D       E  
    ______    ____    _____    ____    ____

    "jre3"    34.6    "yes"    34.6    34.6
    "oii4"       5    "yes"       5       5
    "oks9"      23    "yes"      23      23
    "poj2"    34.6    "yes"    34.6    34.6
    "wba3"      14    "yes"      14      14
    "wen9"     234    "yes"     234     234
    "wnk3"     245    "yes"     245     245
    "abk6"     563    "no"      563     563
    "adw3"      22    "no"       22      22
    "bas8"      23    "no"       23      23
    "dbo8"       5    "no"        5       5
    "pkn4"       2    "no"        2       2
    "ple2"       2    "no"        2       2
    "pnj5"     463    "no"      463     463
    "wnn3"       6    "no"        6       6

C 排序。此时,各行先按 "yes" 分组,然后再按 "no" 分组。然后,按 A 排序。此时,各行按字母顺序列出。

要对表进行重新排序,使 AC 彼此相邻,请使用 movevars

sortedRowsAndMovedVars = movevars(sortedBy2Vars,"C","After","A")
sortedRowsAndMovedVars=15×5 table
      A         C       B       D       E  
    ______    _____    ____    ____    ____

    "jre3"    "yes"    34.6    34.6    34.6
    "oii4"    "yes"       5       5       5
    "oks9"    "yes"      23      23      23
    "poj2"    "yes"    34.6    34.6    34.6
    "wba3"    "yes"      14      14      14
    "wen9"    "yes"     234     234     234
    "wnk3"    "yes"     245     245     245
    "abk6"    "no"      563     563     563
    "adw3"    "no"       22      22      22
    "bas8"    "no"       23      23      23
    "dbo8"    "no"        5       5       5
    "pkn4"    "no"        2       2       2
    "ple2"    "no"        2       2       2
    "pnj5"    "no"      463     463     463
    "wnn3"    "no"        6       6       6

还可以通过索引对表变量进行重新排序。使用圆括号和变量索引来指定输出表中变量的顺序。

sortedRowsAndMovedVars = sortedBy2Vars(:,["A","C","B","D","E"])
sortedRowsAndMovedVars=15×5 table
      A         C       B       D       E  
    ______    _____    ____    ____    ____

    "jre3"    "yes"    34.6    34.6    34.6
    "oii4"    "yes"       5       5       5
    "oks9"    "yes"      23      23      23
    "poj2"    "yes"    34.6    34.6    34.6
    "wba3"    "yes"      14      14      14
    "wen9"    "yes"     234     234     234
    "wnk3"    "yes"     245     245     245
    "abk6"    "no"      563     563     563
    "adw3"    "no"       22      22      22
    "bas8"    "no"       23      23      23
    "dbo8"    "no"        5       5       5
    "pkn4"    "no"        2       2       2
    "ple2"    "no"        2       2       2
    "pnj5"    "no"      463     463     463
    "wnn3"    "no"        6       6       6

另请参阅

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