スタンドアロンアプリケーションの起動時間を短縮することはできません。
もし Figure や GUI環境など、JVMを必要としないアプリケーションをコンパイルするのであれば、以下のように-nojvm オプションを使用してコンパイルすることで、若干起動時間が改善します。
mcc -m -R -nojvm myfun.m
なお、CTF ファイルを事前に展開しておくことによって初回起動時の時間を短縮することは可能です。
詳細については、関連ソリューションを参照してください。
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