MATLAB R2011a から System Object は MATLAB Compiler に対応していますので、コンパイルすることが可能です。
MATLAB R2010b 以前のバージョンをご利用の場合は、下記方法をご参照ください。
直接的に、System Object を含む MATLAB コードから、MATLAB Complier を用いて実行ファイルを作成することができませんが、以下の手順で System Objectを含む MATLAB Code からスタンドアロン化することが可能です。
1. System Object を含む MATLAB コード (Embedded MATLAB) を作成します。
2. 1で作成した MATLAB コードを MEX 化します。
>> emlmex ファイル名
3. 2 で作成した mexファイルを含む MATLAB コードを作成します。
4. 3で作成した MATLAB コードを MATLAB Compiler でスタンドアロン化します。
>> mcc -m ファイル名