% MarkerSize — マーカー サイズ 6 (既定値) | 正の値
% マーカー サイズ。ポイント単位の正の値として指定します。1 ポイントは 1/72 インチです。
マーカーはグラフ内で特定の座標を目立たせる事が目的だから、グラフの表示サイズに左右されない画素単位の大きさで設定する仕様なのでしょう。グラフの表示サイズをdot by dotになるよう固定すればマーカのサイズとグラフの表示が一致するはずです。下図はグラフを拡大縮小表示してもマーカーの大きさが変わらない事を検証した結果です。
上記の様な縛りなくグラフ上に任意の円を描くには、円をプロットするのが妥当だと思います。
plot(10+5*cos(0:0.1:2*pi),10+5*sin(0:0.1:2*pi));
MATLABには、line関数はあってもcircle関数は無い様です。上記のようにplot関数1行で速く描けるから不要ですが。rectangle関数の「角丸機能」を使って円を描く裏技も下記に回答されていますね。またImage Processing Toolboxがあればviscircles関数が本質問の目的に最も適した方法ですね。Circle関数はちょっと用途が異なりますね。
