この種類の細胞取得画像に対してということであれば、Instance Segmentationになると思います。
ただこれは、いわゆるAI・Deep Leaningを用いる手法になり、教師データを揃えるなど準備は必要です。
もう少し簡素にするのであれば、いくつか観察に基づく知見を用いることになります。
例えば、細胞のカタチは楕円である、細胞の面積はおよそXXである、細胞の輪郭はかならず白くハレーションしているなどです。試してはおりませんが、輪郭が白くハレーションしていることなどはそれなりに今回は利用できるように思われますが、もしそうであれば、以下など参考になるかもしれません。