axis_objがどのような値を持っているか確認してみてください
おそらく axis_ob j.YAxis(1).Color で対応可能かなと思っています
clc,clear,close all;
x = linspace(0,10);
y = sin(3*x);
yyaxis left
plot(x,y)
z = sin(3*x).*exp(0.5*x);
yyaxis right
plot(x,z)
ylim([-150 150])
ax = gca
YAxisが怪しそうです
ax.YAxis(1).Color = 'k'
ax.YAxis(2).Color = 'r'