Java クラスや JAR ファイルを追加するために JAVAADDPATH をMATLABプログラムに追加し、コンパイルを行うことは可能です。Java クラスファイルや JAR ファイルは実行形式ファイル(.exe)と同じフォルダに配置します。
配布先での Java クラスファイルや JAR ファイルのロケーションはコンパイルを行うマシンでのそれとは異なります。このため、コンパイルを行う前の MATLAB プログラム(.m) 内で ISDEPLOYED を使用することにより、コンパイル前のファイルとあとのファイルでの動作を制御する必要があります。