>動かしたい変数が2つある際にどのようにすべきか
それらの関連性を見極めれば、一方だけ動かして他方を数式で求める事が出来ます
b = zeros(1323000,1); % bの行列は(1323000,1)の行列
for k = 0:1323
a(k+1,1) = b(max(1,k*1000),1); % bの行列(1,1),(1000,1),(2000,1)...(1323000,1)
end % ⇒aの行列(1324,1)の(1,1),(2,1),(3,1)...(1324,1)に代入
1,1000,2000, ... , 1323000は、1323個ではなく1324個あります。また最初(1000-1)だけ間隔が1000ではなく999になります。
また、for文を回さなくても下記の様に同じデータを得る事が出来ます
a2 = b(max(1,0:1000:1323000),1); % これ1行でもOK!