sim 関数の使用を想定しますが、ドキュメントに下記記載がありオプションでソルバーを指定する事が可能です。
% simOut = sim(modelName,"Solver","ode15s","StopTime","30")
% configures a simulation of the model specified by modelName to use the ode15s solver with a stop time of 30.
% は、ode15s ソルバーを使用してモデルをシミュレートし、SIimulationTime が 30 に達した時にタイムアウトが発生するように指定しています。
ドキュメントには詳細な説明が無いのですが、下記の説明をソルバーに当て嵌めると下記の様に言えます。
% ヒント：sim コマンドを使用して指定されるパラメーターは、
% [モデル コンフィギュレーション パラメーター] ダイアログ ボックスで定義されている値をオーバーライドします。
% 元の構成の値はシミュレーションの最後に復元されます。
