SPM12 を用いた脳3D画像の作成

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Atsuhiko Ninomiya
评论： Atsuhiko Ninomiya 2023-3-20
脳の3D画像（灰白質＋白質）を作成したいと思います．
SPM12を用いて，T1強調画像の元画像の NIfTIデータ A.nii から segmentation を行ったところ，
c1A.nii: 灰白質，c2A.nii: 白質，c3A.nii: 脳脊髄液，c4A.nii: 頭蓋骨，c5A.nii: 脳外軟部組織
の5つの NIfTI データが得られました．
灰白質＋白質の脳3Dのデータ B.nii を作るため，
B.nii = A.nii - c3A.nii - c4A.nii - c5A.nii
なる数式を作成したいのですが，ご教示いただけますでしょうか．
  4 个评论
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Megumi Fukuda
Megumi Fukuda 2023-3-14
.nii画像を読み込み、MATLABで計算してもよいですが、SPMユーザーの方はImCalcを使うのが便利かと思います。
"SPM ImCalc"で検索したり、SPMのドキュメントを見ていただくと良いかと思います。
Atsuhiko Ninomiya
Atsuhiko Ninomiya 2023-3-14
Fukuda様
SPM ImCalcについてご教示くださいましてありがとうございました．
早速ドキュメントなど参照してみます．

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Megumi Fukuda
Megumi Fukuda 2023-3-16
書くところを間違えてしまいました、すみません。質問クローズしたいのでこちらにコメントの内容を転記させていただきます。
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.nii画像を読み込み、MATLABで計算してもよいですが、SPMユーザーの方はImCalcを使うのが便利かと思います。
"SPM ImCalc"で検索したり、SPMのドキュメントを見ていただくと良いかと思います。
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↑のMATLABで処理を行う方法について、.nii画像の読み込み&演算処理&マスク保存を行う場合、MATLABの関数niftiread、niftiwriteも用意されています。もしわからない場合は再度ご連絡ください。
  1 个评论
Atsuhiko Ninomiya
Atsuhiko Ninomiya 2023-3-20
Fukuda様
SPM ImCalcについてご教示くださいましてありがとうございました．
早速ドキュメントなど参照してみます．

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