系統樹と散布図の色を連動させる方法

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早恵香 2023-11-17

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评论： Dyuman Joshi 2023-11-18

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系統樹と散布図の色を連動させるやり方はないのでしょうか。

参照となるコードは以下の通りです。

今回の質問内容を具体的に話せばf3の系統樹をf2の散布図と同じ配色にしたいのですが

load fisheriris

Z = linkage(meas,'average','chebychev'); % 階層クラスターツリーの作成

cutoff = median([Z(end-2,3) Z(end-1,3)]); % クラスターを3つに分けれるよう中間点でカット

f1 = figure;

ZCount = length(find(Z(:,3)>cutoff)) + 1;

[~,Zleaf] = dendrogram(Z,ZCount); % グループ分け

f2 = figure;

orgplot = gscatter(meas(:,1),meas(:,2),Zleaf); % 読み込んだデータをグラフ化して確認

%% 系統樹の出力

f3 = figure;

d = dendrogram(Z,'ColorThreshold',cutoff); % 系統樹を作成

Col = vertcat(d.Color);

[or, ~, idx] = unique(Col, 'rows')

or = 4×3

0 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0

idx = 29×1

3 4 4 4 3 4 4 4 2 3

%配色を設定

newcolors = hsv(4)

newcolors = 4×3

1.0000 0 0 0.5000 1.0000 0 0 1.0000 1.0000 0.5000 0 1.0000

%設定した配色に変更

for k = 1:size(or, 1)

arr = idx==k;

set(d(arr), 'Color', newcolors(k, :))

end

1 个评论
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Dyuman Joshi 2023-11-18

There are 3 groups in the gscatter() whereas there are 4 groups in the dendrogram().

Which groups from the dendrogram should be similar to the gscatter? The bottom three (cyan, magenta and green lines in the above plot) ?

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