"HDL Coder アプリ"で作成したプロジェクトをコマンドを使ってスクリプトにエクスポートできます。
例えば、HDL Coderアプリのワークフローアドバイザーで作成したプロジェクトファイルがtest.prjとします。
test.prjをスクリプトtest_scriptとして生成する場合、
>> coder -tocode test -script test_script
となります。
coderのドキュメントページは、下記より、ご確認ください。
https://jp.mathworks.com/help/coder/ref/coder.html