您好，现在MATLAB实时脚本支持保存为纯文本的m文件格式，您可以观察这种文件格式与您md文件是否类似。
由于md文件格式和扩展众多，其实数学公式也只是各厂商添加的内容，有些会做兼容，但原始的md格式并不支持
如果您能针对md文件进行文本的处理，尤其是程序化的处理，相信您能通过这种方式转换，比起复制粘贴可能会更方便可靠
我刚刚是在matlab 2025b中尝试，可以打开md文件，也可以把实时脚本另存为纯文本的m文件格式。其中实时脚本中插入公式有两种方式，latex方式可能更符合您的需要
我尝试创建了内容类似的md文件和以纯文本m文件格式保存的实时脚本，文件内容对比如下：
md文件：
# 第一节
今天学习圆周率
$$\frac{\pi}{5}$$
纯文本保存的实时脚本：
%[text] ## 第一节
%[text] 今天学习圆周率
%[text] $\\frac{pi}{5}$
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