関数 xlsread は Excel ファイルのセルで数字または文字列以外の情報(書式情報など)が入っていれば、NaN として認識する場合があります。
例えば、データが 2 行目からあって、1 行目の 1 つのセルの色が「赤」に指定されている場合、xlsread 関数では先頭行が NaN として認識されます。
対処方法としては、読み込んだ後に不要な行・列を削除するか、読み込み前に予め、該当の書式を削除しておきます。
シート全体を選択し、「書式をクリア」することで、XLSREAD で NaN が取り込まれなくなります。
Excel において書式をクリアする方法に関しましては、マイクロソフト社による公開情報などをご参照ください。