SLI モードで NVIDIA の GPU をつなげて並列に実行する機能は Parallel Computing Toolbox では提供していません。CUDA エンジンは、2つの GPU が SLI でつながれていても別々のデバイスとして認識します。これは CUDA programming guide の Section 3.2.11.3 に記載されています。
2つの GPU カードを同時に使用したい場合、SLI にせずに GPU 並列化をする方が計算上高速化することができます。parpool コマンドを使用して 2つの MATLAB ワーカーを起動し、gpudevice コマンドでそれぞれのワーカーで別々の GPU を選択するように指定します。例えば parfor を使って以下のように定義します。
parpool(2)
parfor i=1:2
gpudevice(i)
…
end
