R2017a のバージョンでは、Neural Network Toolbox で提供されている CNN (畳み込みニューラルネットワーク; Convolutional Neural Network) のアルゴリズムにおいてのみ複数 GPU を使った計算が可能になっています。
Computer Vision System Toolbox で提供されている R-CNN (領域ベース畳み込みニューラルネットワーク; Region-Based Convolutional Neural Networks) や fast/faster R-CNN の機能は R2017a のバージョンでは複数 GPU での計算に対応していません。
なお、CNN で複数 GPU を使用する方法については次の article をご覧ください。
