現在、グラム行列(カーネル値の行列)が特異行列に近くなっているためにコレスキファクタを計算できないことでエラーが生じているようです。(つまり有効なカーネルの必要条件を満たしていない)
エラーメッセージには以下のような文章があります。
fitrgp を呼び出す場合、'KernelParameters' と 'Sigma' の
初期値を変更してみてください。
また、'Standardize' を true に設定 し、
'SigmaLowerBound' の値を増やすことも検討してください。
FITRGP のデフォルトのカーネルは 'squaredexponential' (二乗指数カーネル) です。 KernelParameters と Sigma が何に対応するかに関しては、 FITRGP のドキュメント 、 カーネル(共分散)関数のオプション にあるカーネルの式、 ガウス回帰モデルのドキュメント が参考になるかと思います。まずは KernelParameters や Sigma のオプションを変更してください。
また、エラーメッセージにあるように、 Standardize オプション を true に設定してください。これにより、ガウス過程回帰を実行する前にデータの標準化(センタリング&スケーリング)をしておくことができ、データのスケールなどに偏りがあった場合に計算時に問題が起こることを防ぎます。