これはあくまでも経験上から回答ですが、コンピュータがクラッシュするというのは壊れて使えなくなるというより、フリーズしたり強制終了したり再起動されたりする様な状況をいいます。 スタックオーバーフロー に関連しています。だいたい再起動すれば元に戻る事が多いですが、勿論保証できません。
まずは、そもそも作られたプログラムは５００回以上再帰的に実行されるべきものなのかをご確認ください。間違いの可能性もありますので。クラッシュしても回復する可能性はありますが、それを期待したプログラミングはできれば避けた方が良いかもしれません。
どうしても、再帰的に書く必要があるならば
set(0,'RecursionLimit',N)
で上限を変えてみてください。
