regionprops の"Image"プロパティをご確認ください。境界ボックスで特定の領域を切り出せます。
%%2値画像の読み込み
if ~exist('test.bmp','file')
websave('test.bmp','https://jp.mathworks.com/matlabcentral/answers/uploaded_files/103040/%3F%3F%3F%3F%3F%3F%3F%3F.bmp');
end
I = imread('test.bmp');
BW = I > 0;
%%面積最大の領域だけ抽出
stats = regionprops('table', BW, 'Area','Image');
[~,idx] = max(stats.Area);
BWtrim = stats.Image{idx};
figure, imshow(BWtrim);
結果：
