MATLAB Coder と MATLAB Compiler の想定される目的と変換可能な関数が異なります。それぞれ、以下のようになります。
■ MATLAB Compiler (およびMATLAB Compiler SDK)
・製品紹介ページ
・製品の目的
MATLAB Compiler は MATLAB プログラムを非 MATLAB 環境で利用するための、スタンドアロン アプリケーションを作成する機能を提供します。スタンドアロンアプリケーションには、実行形式、C/C++ 共有ライブラリ、Excelアドイン、Javaクラス、.Netアセンブリ、などがあります。
・対応関数
GUIによるツール、対話型関数以外の基本的な関数をコンパイルできます。
MATLAB Compilerで対応しているToolboxと関数：
MATLAB Compilerで「対応していない」、MATLAB本体の関数：
■ MATLAB Coder
・製品紹介ページ
・製品の目的
MATLAB Coder は MATLAB プログラムを、C/C++コードに変換します。また、変換されたC/C++コードから、スタティック／共有ライブラリー、（MATLAB なしで実行可能な）EXE、（MATLAB 上で実行できる）MEX を作成することもできます。
・対応関数
C言語に変換可能なMATLAB関数は限られますので、こちらのほうが関数の数は少なくなっております。
MATLAB Coderで対応している関数：
