基本的に敷居が高い処理になるとは思いますが、あくまでもアイディアレベルで次のような方法は如何でしょうか?
1) 入力側のデータに対してプラスアルファで、評価関数に与えたいデータを予め追加しておきます。
2) 従来の入力信号 と 評価関数に与えたいデータを分離します。 こちらの分離作業は、カスタムネットワークにて行うことになると思います。
3) DAGネットワークで従来の畳み込みや全結合層を含む処理と 評価関数に与えたいデータを別ルートとします。
4) myRegressionレイヤの前段で、従来の畳み込みのプロセスから得られた行列と、上記2) で分割した評価関数側に与えたいデータを結合処理します。
5) myRegressionレイヤ側で、カスタム評価関数を定義します。