dendrogram関数の結果から、閾値以下のグループ数をカウントする方法について

Question

denpika 2018-7-17

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https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/410662-dendrogram

评论： denpika 2018-7-18

以下のコードを実行すると閾値0.4以下のノードが4色に塗り分けられますが、塗り分けられた色の数（グループの数）をカウントする方法はないでしょうか？

rng('default') 
X = rand(20,2);
tree = linkage(X,'average');
dendrogram(tree,0,'ColorThreshold',0.4);

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Answer 1

michio 2018-7-17

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https://ww2.mathworks.cn/matlabcentral/answers/410662-dendrogram#answer_329086

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かなり不格好ですが・・ラインハンドル H から全ての色を確認し、何種類の色が存在するかをチェックすることでグループ数を確認できます。

rng('default') 
X = rand(20,2);
tree = linkage(X,'average');
dendrogram(tree,0,'ColorThreshold',0.4);
[H,T,outperm] = dendrogram(tree,0,'ColorThreshold',0.4);
lineColors = vertcat(H.Color); % Lineオブジェクトの色を行列に結合
uniqueColors = unique(lineColors, 'rows'); % ユニークな色（黒も合わせて出てきます）
size(uniqueColors,1) - 1 % 黒以外の色の数