各データファイルには320x640の数値データのみがテキスト形式で保存されているとして、なおかつ全データファイルの内容をメモリ上に展開できるだけのメモリサイズがあるものと仮定します。
そうすると、全データをいったんtimetable型変数としてメモリ上に保持したうえでretime関数で線形補間をすることができます。ファイルの入出力処理も含めて、たとえば以下のようなプログラムではいかがでしょうか。
% 各ファイルに保存されたデータ配列のサイズ
nRow = 320;
nCol = 640;
% データファイル一覧を作成
s = dir('*.txt');
s = struct2table(s);
% 念のためソートっ！
s = sortrows(s,'name');
% ファイル名から6時間刻みのdatetime配列を作成
Time = erase(s.name,'.txt');
Time = datetime(Time,'InputFormat','yyyyMMddHH');
% データ全体を保存するためのtimetable型変数 TT を作成
TT = table(Time);
TT = [TT, array2table(zeros(height(TT),nRow*nCol))];
TT = table2timetable(TT);
% 各ファイルのデータを TT の各行に保存
for kk = 1:height(s)
A = dlmread(s.name{kk});
TT{kk,:} = A(:)';
end
% 2時間刻みのdatetime配列を作成
newTime = (Time(1):hours(2):Time(end))';
% retime関数を使って線形補間
newTT = retime(TT,newTime,'linear');
% 補間により生成したデータのみを保存
for kk = 1:height(newTT)
if ~ismember(newTT.Time(kk),Time)
fileName = [datestr(newTT.Time(kk),'yyyymmddHH'),'.txt'];
A = reshape(newTT{kk,:},nRow,nCol);
dlmwrite(fileName,A);
end
end
