アンインストールと完全に等価ではありませんが、特定の Toolbox のライセンスを一時的に無効にする、という意味で、license コマンドの checktout オプションを使用することもできます。
下記は、Statistics and Machine Learning Toolbox を無効にする方法です。
>> license('checkout','Statistics_Toolbox','disable')
>> nanmean(rand(5))
'nanmean' には Statistics and Machine Learning Toolbox が必要です。
詳しくは、license コマンドのヘルプドキュメント、また、Feature 名については、下記も参考にしてみてください。
コードがどの製品を使っているか、確認する目的であれば、下記も参考になると思います。