Simulinkモデルの特性を取得してボード線図を表示ということでよろしいでしょうか?
まず、Simulinkモデルを図のようにInport/Outportを接続して作成します。

次にMATLABで以下の様にコードを実行します。
Ts = 1/1000 % Tsはサンプル時間
[num,den] = dlinmod(gcs, Ts) % gcsでカレントのシステムを取得
sys = tf(num,den, Ts)
bode(sys) % ボード線図表示

各関数の機能はヘルプでご確認ください。