ベースワークスペースの値を MATLAB Function 内で使用するということであれば、MATLAB Function の入力引数として取り込むことで、利用可能になります。
下記のような形で使えます。
function y = fcn(x,'変数A')
y = 変数A * x;
入力引数として定義するには、MATLAB Functionエディタにある 'データの編集' を開き、変数を追加し、取り込みたい変数名を定義して、スコープを 'パラメータ' に設定します。
関連ドキュメントが、下記ドキュメントページにもあります。