こちらのリンクが参考になるかもしれません。プロキシサーバーか、ファイアウォールでブロックされている可能性があります。プロキシサーバーを経由する場合、Webアプリサーバーのインストール時に「接続設定」をクリックしてプロキシサーバーの情報を入力します。
あるいは、一時的にMathWorksのサーバーと接続できない状態になっているだけかもしれませんので、MATLAB Runtimeのインストーラーを以下のURLからダウンロードして、先にRuntimeだけインストールしてしまうことで解決できるかもしれません。