このページが参考になるかもしれません。
少し工夫するとこんな感じにできます。
exl = actxserver('excel.application');
exlWkbk = exl.Workbooks;
[filename,pathname] = uigetfile('*.xls;*.xlsx','ファイルを選択してください');
exlFile = exlWkbk.Open(fullfile(pathname,filename));
exl.Visible = true;
ここで Excel ファイルのセルを選択
sel = exl.ActiveCell.Value
exl.Quit
