Model ブロックに 2x1 の配列を入力とありますが、Model ブロック内の Inport ブロックで外部入力するという意味でしたら、Inport ブロックのブロックプロパティを開いて、[信号属性]タブから[端子の次元]の設定が必要かと思います。2x1 の配列が外部から入力される場合は、[端子の次元]を2に設定すれば良いかと思います。
Model ブロック境界では信号次元やデータ型が伝搬されないみたいですので、明示的に定義が必要そうです。
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