Autoencoder オブジェクトにつきましては、SeriesNetwork または DAGNetworkのような深層学習系ではなく、 shallow network 系のオブジェクトの一つとなり、両者間には相互方向の互換性(変換等のメソッドの提供)は残念ながらありません。
現状、オートエンコーダ型のネットワークから直接的に紹介できそうな方法としては、下記例の様に、 trainAutoencoder から生成された Autoencoderオブジェクトからの変換ではなく、 SeriesNetwork オブジェクトとして、オートエンコーダ型ネットワークを作成するという方法になってしまいます。
直接的な例ではありませんが、下記のような Shippingデモが参考になれそうです。
>> web(fullfile(docroot, 'deeplearning/examples/image-to-image-regression-using-deep-learning.html'))
