各比較で得られた統計値を配列として格納して mat ファイルに保存もできそうですが、いかがでしょうか。以下のようなコードになるかなと思います
% テーブルデータ DATA の 2 列目から 12 列目の数値データを数値配列 testData として抽出
testData = DATA{:,2:12};
% testData の行数(m),列数(n)を取得
[m,n] = size(testData);
for k=1:n
% testData から 1 行目から 19 行目の k 列を抽出
A = testData(1:19,k);
% testData から 21 行目から 40 行目の k 列を抽出
B = testData(21:40,k);
% 配列として結果を格納
[p(k),h(k),stats(k)] = ranksum(A, B,'alpha', 0.05, 'tail','both')
end
% ワークスペースの変数を myfile.mat に保存
save myfile