Figure の更新を完全に止めるというよりは、更新回数を制限することは可能です。
drawnow limitrate
によると
「drawnow limitrate は、更新回数を 20 フレーム/秒に制限します。前回の更新から 50 ms 以内の場合、あるいは前の変更によりグラフィックス レンダラーがビジー状態になっている場合、drawnow は新規の更新を破棄します。ループ内で graphics オブジェクトを更新していて個々の更新を画面に表示する必要がない場合に、このコマンドを使用します。」
とのこと。役に立ちますでしょうか。