提示のスクリプトだと「上書き」じゃなくて、「末尾に追加」になっています。
「上書きすることなく数値を書き込みたい」という要望通りの動作になっているはずですが、求めている出力イメージとは違う結果なんだと思います。
「数値を追加で書き込んでいく」の出力イメージはどんなものですか?この質問はそこから確認する必要があるような気がします。
↓提示されたスクリプトを2回実行した場合の出力結果。
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