saving files after export with the same name as original file

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Alberto Martínez
Alberto Martínez 2020-12-17
编辑： Stephen23 2020-12-19
hello!
I have several .asc files with different names. After filter this data I want to export each file to a .xlsx file and save each file with the same name as original .asc file. I'm not able to achive this last thing.
a sample of the different .asc file names:
6969_2020_11_23_0001_INT-17_filter
6969_2020_11_23_0002_T200-5_filter
I hope someone can help me with this issue. I attach the code.
Thanks a lot.
Kind regards,
close all
clear
clc
archivos=ls('*.asc'); %crea una lista con los archivos .asc
for i=1:length(archivos(:,1)) %bucle que recorra todos los archivos
%importo y selecciono los datos
estructura_datos=importdata(archivos(i,:));
datos=estructura_datos.data;
%ordeno por profundidad ascendente
ordenado_por_profundidad=sortrows(datos,1);
%localizar y eliminar datos erróneos
posicion_datos_erroneos=find(ordenado_por_profundidad(:,19)==-9.990e-29); %localiza flags erróneos
ordenado_por_profundidad(posicion_datos_erroneos,:)=[]; %elimina filas donde hay flag erróneo
%localizar y eliminar profundidad < 1m
posicion_menor_1m=find(ordenado_por_profundidad(:,1)<1); %localiza posiciones <1m
ordenado_por_profundidad(posicion_menor_1m,:)=[]; % elimina filas con profundidades <1 m
%sustituyo columnas de salinidad por las corregidas
ordenado_por_profundidad(:,[3 4 17 18])=ordenado_por_profundidad(:,[17 18 3 4]); %corrijo la salinidad
ordenado_por_profundidad(:,[13:15 17 18 19])=[]; %elimino columnas que no me interesan
%creo una tabla
Profundidad = ordenado_por_profundidad(:,1);
Temperatura = ordenado_por_profundidad(:,2);
Salinidad = ordenado_por_profundidad(:,3);
Sigma = ordenado_por_profundidad(:,4);
Clorofila = ordenado_por_profundidad(:,5);
Turbidez = ordenado_por_profundidad(:,6);
Ox = ordenado_por_profundidad(:,7);
Ox2 = ordenado_por_profundidad(:,8);
Cloi = ordenado_por_profundidad(:,9);
Par = ordenado_por_profundidad(:,10);
Ph = ordenado_por_profundidad(:,11);
Carb = ordenado_por_profundidad(:,12);
Tiempo = ordenado_por_profundidad(:,13);
Tabla=table(Profundidad,Temperatura,Salinidad,Sigma,Clorofila,Turbidez,Ox,Ox2,Cloi,Par,Ph,Carb,Tiempo);
%exporto los datos a formato excel
writetable(Tabla,['6969_2020_11_23_' num2str(i) '.xlsx'],'Sheet',1,'Range','A1');
end
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Cris LaPierre
Cris LaPierre 2020-12-18
ls saves the folder oontents to a cell array. It does still work, but at least on my machine, you'd want to start the for loop at 3 since the first 2 entries were . and ..
Still, dir is the better choice.
Stephen23
Stephen23 2020-12-18
编辑：Stephen23 2020-12-19
"...you'd want to start the for loop at 3 since the first 2 entries were . and .."
Misleading advice. Better advice:
https://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/345841-unexplained-error-on-dir#answer_271627
https://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/21150-function-call#comment_46042
https://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/394807-create-text-file-containing-list-of-file-names#comment_556641
https://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/288815-gui-for-loop-not-working-correctly#answer_224956
https://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/484430-using-struct-dir-selpath-what-do-and-mean-as-struct-name#answer_395754
https://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/40949-omitting-pointers-when-listing-folder-contents#answer_50568
https://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/13978-list-of-files-sorting#answer_19278
As Walter Roberson wrote in that last link: "In short: if your code assumes that '.' and '..' are the first two entries in a directory, your code has a bug (even in MS Windows). If your code assumes that directory entries are returned in any sorted order, your code has a bug (in all OS.)"

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Image Analyst
Image Analyst 2020-12-18
编辑：Image Analyst 2020-12-18
Try this:
archivos = dir('*.asc'); %crea una lista con los archivos .asc
for k=1:length(archivos) %bucle que recorra todos los archivos
inputFileName = fullfile(archivos(k).folder, archivos(k).name);
% Output filename is the same except for a .xlsx extension instead of .asc.
outputFileName = strrep(lower(inputFileName), '.asc', '.xlsx');
% remainder of your code follows.
% etc.
%exporto los datos a formato excel
writetable(Tabla, outputFileName, 'Sheet',1, 'Range','A1');
end
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Image Analyst
Image Analyst 2020-12-18
Alberto, I did this with your actual data files and it worked perfectly. I think you didn't incorporate my code correctly, especially when sending the input file name into importdata():
clear all
clc
archivos = dir('*.asc'); %list with .asc files
for k=1:length(archivos) %loop
fprintf('\nProcessing file #%d of %d...\n', k, length(archivos));
inputFileName = fullfile(archivos(k).folder, archivos(k).name);
% Output filename is the same except for a .xlsx extension instead of .asc.
outputFileName = strrep(lower(inputFileName), '.asc', '.xlsx');
%import and select data
estructura_datos=importdata(inputFileName);
datos=estructura_datos.data;
%sort by increasing depth
ordenado_por_profundidad=sortrows(datos,1);
%locate and delete outliers
posicion_datos_erroneos=find(ordenado_por_profundidad(:,19)==-9.990e-29); %localiza flags erróneos
ordenado_por_profundidad(posicion_datos_erroneos,:)=[]; %elimina filas donde hay flag erróneo
%locate and delete depth < 1m
posicion_menor_1m=find(ordenado_por_profundidad(:,1)<1); %localiza posiciones <1m
ordenado_por_profundidad(posicion_menor_1m,:)=[]; % elimina filas con profundidades <1 m
%change salinity columns and delete the non-corrected ones
ordenado_por_profundidad(:,[3 4 17 18])=ordenado_por_profundidad(:,[17 18 3 4]); %corrijo la salinidad
ordenado_por_profundidad(:,[13:15 17 18 19])=[]; %elimino columnas que no me interesan
%create a table
Profundidad = ordenado_por_profundidad(:,1);
Temperatura = ordenado_por_profundidad(:,2);
Salinidad = ordenado_por_profundidad(:,3);
Sigma = ordenado_por_profundidad(:,4);
Clorofila = ordenado_por_profundidad(:,5);
Turbidez = ordenado_por_profundidad(:,6);
Ox = ordenado_por_profundidad(:,7);
Ox2 = ordenado_por_profundidad(:,8);
Cloi = ordenado_por_profundidad(:,9);
Par = ordenado_por_profundidad(:,10);
Ph = ordenado_por_profundidad(:,11);
Carb = ordenado_por_profundidad(:,12);
Tiempo = ordenado_por_profundidad(:,13);
Tabla=table(Profundidad,Temperatura,Salinidad,Sigma,Clorofila,Turbidez,Ox,Ox2,Cloi,Par,Ph,Carb,Tiempo);
% etc.
%exporto los datos a formato excel
fprintf('Input File : %s\nOutput File : %s\n', inputFileName, outputFileName);
writetable(Tabla, outputFileName, 'Sheet',1, 'Range','A1');
end
Alberto Martínez
Alberto Martínez 2020-12-18
Thank you so much!
You're right and I don't hesitate about it.
I'm sorry but I'm trying to resume Matlab after a few years and I'm a little bit rusty. I'll keep learning because I want to improve.
Thanks a lot!
Take care!

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Alberto Martínez
Alberto Martínez 2020-12-18
Dear all,
thank you very much for your answers! I'm sorry but I forgot to attach sample files. I do it now.
My script works well, but the only thing that I want to improve is exporting the .asc file to an .xls file with exactly the same name as the original .asc file.
I tried with the code from Image Analyst (thank you very much ;)) but I'm afraid I make some mistake.
Now you can find my original code with 2 sample files.
Thank you very much to all of you!
Kind regards
close all
clear
clc
archivos=ls('*.asc'); %list with the .asc files
for i=1:length(archivos(:,1)) %bloop
%import and select data
estructura_datos=importdata(archivos(i,:));
datos=estructura_datos.data;
%sort by increasing depth
ordenado_por_profundidad=sortrows(datos,1);
%locate and erase outliers
posicion_datos_erroneos=find(ordenado_por_profundidad(:,19)==-9.990e-29); %localiza flags erróneos
ordenado_por_profundidad(posicion_datos_erroneos,:)=[]; %elimina filas donde hay flag erróneo
%locate and erase depth <1 m
posicion_menor_1m=find(ordenado_por_profundidad(:,1)<1); %localiza posiciones <1m
ordenado_por_profundidad(posicion_menor_1m,:)=[]; % elimina filas con profundidades <1 m
%change columns and erase the columns that I don't need
ordenado_por_profundidad(:,[3 4 17 18])=ordenado_por_profundidad(:,[17 18 3 4]); %corrijo la salinidad
ordenado_por_profundidad(:,[13:15 17 18 19])=[]; %elimino columnas que no me interesan
%create a table
Profundidad = ordenado_por_profundidad(:,1);
Temperatura = ordenado_por_profundidad(:,2);
Salinidad = ordenado_por_profundidad(:,3);
Sigma = ordenado_por_profundidad(:,4);
Clorofila = ordenado_por_profundidad(:,5);
Turbidez = ordenado_por_profundidad(:,6);
Ox = ordenado_por_profundidad(:,7);
Ox2 = ordenado_por_profundidad(:,8);
Cloi = ordenado_por_profundidad(:,9);
Par = ordenado_por_profundidad(:,10);
Ph = ordenado_por_profundidad(:,11);
Carb = ordenado_por_profundidad(:,12);
Tiempo = ordenado_por_profundidad(:,13);
Tabla=table(Profundidad,Temperatura,Salinidad,Sigma,Clorofila,Turbidez,Ox,Ox2,Cloi,Par,Ph,Carb,Tiempo);
%export to excel (I WANT THE SAME NAME AS .asc ORIGINAL)
writetable(Tabla,['6969_2020_11_23_' num2str(i) '.xlsx'],'Sheet',1,'Range','A1');
end
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Image Analyst
Image Analyst 2020-12-18
My code correctly constructs the filename. I tested it. What did you do wrong? You forgot to attach your code after you incorporated my code into it. Please do so, so I can fix it.

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