MATLABはデフォルトの構成要素背景色としてGUI が動作しているシステム上で、標準的なシステム背景色を使用します。この色の種類はコンピューターシステムによって異なります。例えば、灰色の色合いは Windows と UNIX で異なり、GUI のデフォルト背景色が一致しないことがあります。
問題を回避するには、MATLAB 起動時に次のコマンドを実行してください。
set(0,'defaultuicontrolBackgroundColor',get(0,'defaultFigureColor'))