Simulink はファイルベースで動作しているため、SCCI なしでも Subversion を使用できます。
モデルやその他必要となるファイルは、適切なファイルを簡単にチェックすることで、バージョン管理することができます。Subversion に対しては、フリーツールの TortoiseSVN があります。
(参考 Windows Shell Extension for Subversion
なお、全ての必要なファイルがバージョンコントロールでチェックできるか確認するには、Simulink Model Dependency Analysis を使用してください。
・Simulink ユーザー ガイド:モデルの依存関係
また、既に開かれたモデルが選択されているかどうか確認するには、Simulink の Model File Change Notificationをご覧ください。
・Simulink ユーザー ガイド:モデル ファイルの変更通知