生物医学信号处理

什么是生物医学信号处理?

生物医学信号处理涉及采集和预处理生理信号,以及提取有意义的信息以识别信号中的模式和趋势。

生物医学信号源包括神经活动、心律、肌肉运动和其他生理活动。心电图 (ECG)、脑电图 (EEG)、肌电图 (EMG) 等信号可以通过非侵入性方式采集,并用作诊断工具和整体健康指标。

生物医学信号处理工作流包括:

  • 信号采集
  • 信号可视化和注释
  • 伪影去除和预处理
  • 特征提取

提取的特征随后将馈送到分类模型中或直接用于诊断。

生物医学信号处理工作流。

生物医学信号处理工作流。

MATLAB® 为此工作流提供许多信号处理功能,对于信号预处理和特征提取尤为如此。

信号采集:借助 MATLAB,您可以对接硬件设备来采集生理信号。例如,您可以使用 Raspberry Pi 和 Arduino 支持包,对接 Raspberry Pi、Arduino 和 EKGShield 等嵌入式板,以便从这些传感器中采集数据。您还可以访问和分析文件(例如 EDF、Excel® 和 MAT 文件)中存储的信号。

信号可视化和注释:MATLAB 提供内置 App,可帮助您在时域、频域和时频域中分析和可视化信号,而无需编写任何代码。借助这些功能,您可以了解哪些预处理方法可用来提高信号所含信息的质量。

您还可以使用信号标注器对生物医学信号进行注释,并使它们为机器学习和深度学习等下游工作流做好准备。信号可以手动标注,也可以使用算法(例如寻找峰值和转变点的算法)标注。

使用 MATLAB 中的信号分析器在时域、频域和时频域中分析 ECG 信号。

使用 MATLAB 中的信号分析器在时域、频域和时频域中分析 ECG 信号。

伪影去除和信号滤波:生物医学信号通常包含噪声或不需要的伪影,它们可能会影响信号的分析。例如,在测量 EKG 信号时,呼吸和步行等活动可能会增加不需要的信号成分。生物医学信号预处理的主要挑战之一是去除不需要的伪影,同时保留信号中的尖锐特征。最常见的伪影去除方法是数字滤波、自适应滤波、独立分量分析 (ICA) 和递归最小二乘法。您也可以组合使用各种预处理方法来突破单一方法的局限性。

用于信号预处理的数字滤波器。

用于信号预处理的数字滤波器。

通过信号处理进行特征提取:特征提取可以手动完成,也可以自动完成。AR 建模、傅里叶分析和频谱估计等信号处理方法可用于手动计算信号的关键特征。时频变换,例如短时傅里叶变换 (STFT),可用作机器学习和深度学习模型中的训练数据的信号表示。小波散射等自动特征提取方法可用于降维和提取重要特征。这些特征可直接用于诊断,也可用作机器学习和深度学习分类器的输入。

时频分析用于从 ECG 信号中提取特征以进行分类。

时频分析用于从 ECG 信号中提取特征以进行分类。

在开发信号处理算法后,您可以通过自动生成实时代码进行原型设计和创建概念验证。您还可以生成 VHDL 和 Verilog 代码,在 FPGA 和 ASIC 等设备上部署信号处理算法,以便原型化和构建低功耗医疗设备。MATLAB Coder™ 和 Embedded Coder™ 可用于生成优化的 C/C++ 代码,以在嵌入式硬件上部署算法。高性能 GPU 可用于加速预处理、特征提取和模型推断。

有关详细信息,请参阅 Signal Processing Toolbox™ 和 Wavelet Toolbox™


生物医学信号处理常见问题

生物医学信号处理涉及获取和预处理生理信号,并提取有意义的信息,以识别信号中的模式和趋势,用于诊断和健康监测。

常见的生物医学信号包括用于心律的心电图 (ECG)、用于神经活动的脑电图 (EEG)、用于血容量变化的光电容积脉搏波 (PPG) 以及用于肌肉运动的肌电图 (EMG),这些信号可以非侵入性地采集。

工作流程主要步骤包括信号采集、信号可视化与标注、伪影去除与预处理,以及特征提取。提取的特征可用于机器学习模型,或供医疗专业人员直接进行诊断。

生物医学信号通常包含会扭曲分析的噪声或不需要的伪影。主要挑战之一是在去除这些伪影的同时保留信号中的有意义特征。

常用技术包括数字滤波、自适应滤波、独立成分分析 (ICA) 和递归最小二乘。通常会结合多种预处理技术以弥补单一方法的局限。

特征提取可以通过手动使用信号处理技术来完成,例如自回归 (AR) 建模、傅里叶分析和频谱估计,或通过自动化方法例如小波散射来降低维度并提取特征。

MATLAB 为整个工作流程提供信号处理能力,包括用于信号采集的仪器控制、用于可视化与标注的内置应用、预处理工具,以及用于机器学习和深度学习的特征提取技术。

可以。您可以使用 MATLAB Coder、Embedded Coder、GPU Coder 和 HDL Coder 生成优化后的 C、C++、CUDA 和 HDL 代码,将算法部署到嵌入式处理器、云端或 FPGA 与 ASIC,以构建低功耗医疗设备。


另请参阅: 医疗设备, DSP System Toolbox™, Statistics and Machine Learning Toolbox™, 嵌入式代码生成, 用于 MATLAB 中信号处理算法的 GPU